Ο Γιάννης Θεοδωράκης είναι αντιπρύτανης στο Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, και καθηγητής Αθλητικής Ψυχολογίας στο Τμήμα Επιστήμης Φυσικής Αγωγής και Αθλητισμού. Επίσης είναι πρόεδρος της Ελληνικής Ακαδημίας Φυσικής Αγωγής, εκδότης του περιοδικού "Αναζητήσεις στη Φυσική Αγωγή και τον Αθλητισμό" και μέλος του editorial board του περιοδικού "Psychology of Sport and Exercise". Διετέλεσε μεταξύ των άλλων, πρόεδρος για 6 χρόνια του τμήματός του, πρόεδρος της Ελληνικής Εταιρείας Αθλητικής Ψυχολογίας, μέλος του Managing Council της European Society of Sport Psychology, και μέλος επιστημονικών επιτροπών αρκετών ελληνικών και διεθνών περιοδικών σχετικών με τη φυσική αγωγή και την αθλητική ψυχολογία. Έχει δημοσιεύσει περισσότερες από 150 εργασίες σε διεθνή και ελληνικά περιοδικά, πολλές παρουσιάσεις σε συνέδρια, σεμινάρια ή ημερίδες, ενώ είναι συγγραφέας με συνεργάτες του αρκετών βιβλίων σχετικών με τη φυσική αγωγή και την αθλητική ψυχολογία ("Ψυχολογική Υπεροχή στον Αθλητισμό", "Για μια καλύτερη Φυσική Αγωγή", "Οργάνωση προγραμμάτων Αγωγής Υγείας", "Φυσική Αγωγή για το Γυμνάσιο", "Πρόγραμμα Καλλιπάτειρα", "Ψυχολογική Υποστήριξη στο στίβο", "Η Ψυχολογία στα Γυμναστήρια"). Τα ερευνητικά του ενδιαφέρονται εστιάζονται σε θέματα στάσεων και πρόβλεψη συμπεριφοράς, ψυχολογικών τεχνικών και μεγιστοποίησης της απόδοσης και άσκησης και υγείας.