Η Μαίρη Μαργαρώνη σπούδασε Ελληνική Φιλολογία στο ΑΠΘ, στο Freie Universitat Βερολίνου και στο Αµβούργο Γερµανίας (1987-1991), Νοσηλευτική στην Κρατική Νοσηλευτική Σχολή Altona στο Αµβούργο (1992-1995), Γερµανική Φιλολογία στο ΕΚΠΑ και το Πανεπιστήµιο της Caen στη Γαλλία (1996-2000), Ιστορία, Αρχαιολογία και Κοινωνική Ανθρωπολογία (2000-2005) και Ειδική Αγωγή (2006-2010) στο Πανεπιστήµιο Θεσσαλίας (ΠΘ). Έκανε µεταπτυχιακές σπουδές στην Ιστορία και την Κοινωνική Ανθρωπολογία στο ΠΘ (2004-2006), την Εκπαίδευση Ενηλίκων στο ΕΑΠ (2010-2013), τη Θεατρική Εκπαίδευση στο Ανοιχτό Πανεπιστήµιο Κύπρου (2011-2014) και την Ευρωπαϊκή Λογοτεχνία και Πολιτισµό στο ΑΠΘ (2011-2014). Είναι υποψήφια διδάκτωρ στη Σύγχρονη Κοινωνική Ιστορία στο Κέντρο Αντισηµιτικών Ερευνών του Βερολίνου. Εργάστηκε στον χώρο της υγείας, της εκπαίδευσης και της έρευνας στη Γερµανία, την Ελλάδα και το Βέλγιο, ενώ από το 2012 είναι επικεφαλής ερευνήτρια στο Ινστιτούτο Έρευνας και Κατάρτισης Ευρωπαϊκών Θεµάτων. Τα επιστηµονικά της ενδιαφέροντα και οι δηµοσιεύσεις της εστιάζονται σε ζητήµατα γλώσσας, εκπαίδευσης και κοινωνικού βίου µειονοτικών οµάδων.