Σεπτέμβριος 1858: Η γυναίκα ενός φαλαινοθήρα ανακαλύπτει ένα πλοίο-φάντασμα στην Ανταρκτική, το παγωμένο πλήρωμά του κι ένα μαύρο κρανίο από οψιδιανό. Μάρτιος 2001: Μια ομάδα ανθρωπολόγων ανακαλύπτει έναν υπόγειο θάλαμο με παράξενες αρχαίες επιγραφές στο Κολοράντο και... γίνεται στόχος άγνωστων δολοφόνων. Απρίλιος 2001: Ένα υποβρύχιο που εμφανίζεται από το πουθενά κι είχε εξαφανιστεί στο Β΄ Παγκόσμιο Πόλεμο προσπαθεί να βυθίσει ένα ερευνητικό πλοίο της Υπηρεσίας Υπόγειων και Θαλάσσιων Υδάτων (NUMA) πάνω στο οποίο βρίσκεται ο Ντερκ Πιτ.
Ο Πιτ ξέρει ότι με κάποιον τρόπο όλα αυτά τα περιστατικά συνδέονται μεταξύ τους και οι έρευνές του τον οδηγούν σε ένα αρχαίο μυστήριο με σύγχρονες συνέπειες. Τώρα πρέπει να σώσει όχι μόνο τον εαυτό του αλλά και ολόκληρο τον κόσμο...