Η Τρισεύγενη Γιαννακοπούλου γεννήθηκε στην Αθήνα. Έχει πτυχίο βιολογίας από το Τμήμα Βιολογίας του Πανεπιστημίου Αθηνών, B.Sc στη βιολογία από το Πανεπιστήμιο McGill του Καναδά με εξειδίκευση στην οικολογία και τα υδατικά οικοσυστήματα και διδακτορικό δίπλωμα από το Τμήμα Πολιτικών Μηχανικών του Δημοκριτείου Πανεπιστημίου Θράκης. Είναι αναπληρώτρια καθηγήτρια στο ίδιο Τμήμα και διδάσκει οικολογία για μηχανικούς και ποιότητα νερού σε προπτυχιακό επίπεδο και φυσικές, χημικές και βιοχημικές διεργασίες νερού σε μεταπτυχιακό επίπεδο.