Η Μαρία Μπονάνου Παπαγιαννάκη έχει ανακηρυχθεί επίτιμος δημότης του Newton στις Η.Π.Α και έργα της εκτίθενται στο Smithsonian Institution United States National Museum.Έχει λάβει ευχαριστήριο απαντητική επιστολή των τριών Αστροναυτών του Apollo 11, από το Ειδικό Κέντρο Αστροναυτών στην πόλη Χιούστον της πολιτείας του Τέξας στις Η.Π.Α., για τα ειδικώς σχεδιασμένα κεραμικά αντικείμενα τα οποία τους απέστειλε ως δώρο. Ένα ενθύμιο για το ηρωικό εγχείρημά τους το οποίο τιμά ολόκληρη την ανθρωπότητα.Έχει λάβει τιμητικό δίπλωμα και ειδική διάκριση από το Υπουργείο Προεδρίας Κυβερνήσεως. Έχει λάβει ευχαριστήρια επιστολή από τον Δήμαρχο Χανίων Νικολάου Πιμπλή στις 31-8-1972 για την προσφορά δύο έργων της για τους τάφους των Ελευθερίου και Σοφοκλή Βενιζέλου και ενός έργου της για τον Δήμο Χανίων.Τιμήθηκε με Δίπλωμα από τον Σύνδεσμο Βιοτεχνών Αγγειοπλαστικής και Κεραμικής Τέχνης Αμαρουσίου για τη συμμετοχή της στην Πανελλήνιο Έκθεση Κεραμικής.