Ο Ιωάννης Γαρυφαλλάκης γεννήθηκε στην Άνω Βιάννο Ηρακλείου Κρήτης. Είναι πτυχιούχος της Εκκλησιαστικής Σχολής Χανίων (Αγία Τριάδα) και της Θεολογικής Σχολής του Πανεπιστημίου Αθηνών. Υπηρέτησε ως καθηγητής θεολόγος σε γυμνάσια του νομού Ηρακλείου και Λασιθίου. Σήμερα είναι συνταξιούχος εκπαιδευτικός και διαμένει στο Ηράκλειο. Είναι παντρεμένος και έχει δυο παιδιά.