Ο Ιωάννης Αμπατζόγλου κατάγεται από την πόλη της Δράμας. Είναι κάτοχος πτυχίου Φυσικής του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών, όπως επίσης μεταπτυχιακού τίτλου (MSc) και διδακτορικού διπλώματος (PhD) στην Ιατρική Φυσική - Ακτινοφυσική του Τμήματος Ιατρικής του Δημοκριτείου Πανεπιστημίου Θράκης. Κατέχει τη θέση του Επιστημονικά Υπεύθυνου του Τμήματος Ιατρικής Φυσικής στο Πανεπιστημιακό Γενικό Νοσοκομείο Αλεξανδρούπολης στο οποίο εργάζεται ως Ακτινοφυσικός από το 2002. Με Μελέτες και Εκθέσεις του, έχουν αδειοδοτηθεί όλα τα Τμήματα του συγκεκριμένου Νοσοκομείου που κάνουν χρήση ακτινοβολιών, όπως επίσης έχει ιδρύσει το πρώτο Τμήμα Ιατρικής Φυσικής του Ε.Σ.Υ. σε Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο της Ελλάδος.Έχει δημοσιεύσει είκοσι τρεις επιστημονικές εργασίες σε διεθνή επιστημονικά περιοδικά με κριτές και είναι κριτής σε επτά διεθνήεπιστημονικά περιοδικά.Συμμετείχε στις διαμαρτυρίες στο Πισοδέρι της Φλώρινας στις 17 Ιουνίου 2018 τη στιγμή κατά την οποία στις Πρέσπες παραδιδόταν το όνομα της Μακεδονίας στους Σκοπιανούς. Έχει δημιουργήσει ομάδα στο Facebook με τίτλο 'Πισοδέρι 2018 - Επιτροπή Αγώνα' και αγωνίζεται για την ακύρωση της Συμφωνίας των Πρεσπών.