Ο Ηρακλής Γωνιάδης είναι πτυχιούχος του Τμήματος Οικονομικών Επιστημών της Σχολής Νομικών & Οικονομικών Επιστημών του ΑΠΘ και κατέχει το Δίπλωμα Μεταπτυχιακών Σπουδών του ίδιου τμήματος. Από το 2007 είναι Διδάκτορας του Τμήματος Διεθνών Οικονομικών Σχέσεων και Ανάπτυξης του Δημοκρίτειου Πανεπιστημίου Θράκης.