Ο Γιάννης Νικολής γεννήθηκε στον Θεολόγο, ένα ορεινό χωριό της Θάσου. Οι σπουδές του τον οδήγησαν στην Καβάλα αρχικά και κατόπιν στη Θεσσαλονίκη, όπου και το 1982 τελείωσε την Ιατρική Σχολή. Ειδικεύθηκε στην Ψυχιατρική και εκπαραλλήλου εκπαιδεύθηκε στην Ομαδική Ανάλυση. Είναι πλήρες μέλος της "Group Analytic Society International" και ιδρυτικό μέλος του "Ελληνικού Δικτύου Ομαδικών Αναλυτών". Το 1996 αναγορεύθηκε Διδάκτορας Ψυχιατρικής του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου. Έχει εργασθεί για πολλά χρόνια ως ελεύθερος επαγγελματίας αλλά και σε δημόσιες θέσεις. Το 2012 ίδρυσε τη Λέσχη Φιλελεύθερου Προβληματισμού στη Θεσσαλονίκη και το 2018 το Κέντρο Ψυχοθεραπείας και Προσωπικής Ανάπτυξης, όπου και δραστηριοποιείται επαγγελματικά.