Ο Εμμανουήλ Γ. Γούναρης, υιός του γεωπόνου Γεωργίου Γούναρη και της Πηνελόπης Γούναρη το γένος Αλεξοπούλου, γεννήθηκε στην Πάτρα και μεγάλωσε στη Λευκάδα. Μετά τις εγκύκλιες σπουδές του, σπούδασε Πολιτικές, Οικονομικές, Κοινωνικές, Νομικές επιστήμες και Ιστορία στα Πανεπιστήμια της Βιέννης, της Γοπίγγης, της Θεσσαλονίκης και του Βερολίνου, ανακηρυχθείς το 1976 Διδάκτωρ Φιλοσοφίας (PhD) στο Ελεύθερο Πανεπιστήμιο του Δυτικού Βερολίνου (F.U.)· Έκτοτε εισήλθε στο Υπουργείο των Εξωτερικών, στον κλάδο των Εμπειρογνωμόνων, όπου και υπηρετεί ως Εμπειρογνώμων Πρεσβευτής. Ως Διεθνολόγος-Ιστορικός ασχολείται στο Υπουργείο Εξωτερικών με θέματα Δικαίου της Θαλάσσης, Αρκτικής, Ανταρκτικής και Γεωγραφικών Ονομάτων, εκπροσωπώντας την Ελλάδα ως αρχηγός ή μέλος Ελληνικών Αντιπροσωπειών σε Διεθνείς Διασκέψεις σε όλους τους Διεθνείς Πολιτικούς Οργανισμούς που ασχολούνται με τα θέματα αυτά. Συγχρόνως διδάσκει Διεθνές Δίκαιο και Διπλωματική Ιστορία στο Τμήμα Μεσογειακών Σπουδών και Διεθνών Σχέσεων του Πανεπιστημίου Αιγαίου στη Ρόδο. Έχει γράψει αρκετά άρθρα για θέματα Διεθνούς Δικαίου και Διπλωματικής Ιστορίας, όπως επίσης βιβλία και μονογραφίες στα Ελληνικά, Αγγλικά, Γερμανικά και Ιταλικά.