Ο Παναγιώτης Ζουμπουλάκης γεννήθηκε το 1974 στην Αθήνα, σπούδασε στο Τμήμα Χημείας του Πανεπιστημίου Πατρών, απ' όπου αποφοίτησε το 1999. Το 2004 έλαβε από το ίδιο τμήμα Διδακτορικό δίπλωμα στη μελέτη διαμορφώσεων φαρμακευτικών μορίων και των αλληλεπιδράσεων τους με βιολογικές μεμβράνες και πρωτεϊνικούς υποδοχείς. Το πειραματικό μέρος της διατριβής πραγματοποίησε στο Ινστιτούτο Οργανικής και Φαρμακευτικής Χημείας (ΙΟΦΧ) του Εθνικού Ιδρύματος Ερευνών (ΕΙΕ), στο Κέντρο NMR του Ινστιτούτου Χημείας της Σλοβενίας (ΚΙ) καθώς και στο Ινστιτούτο Βιοφυσικών Ερευνών (IBR) της Αυστριακής Ακαδημίας Ερευνών. Το 2005 έλαβε υποτροφία από το Ίδρυμα Κρατικών Υποτροφιών για μεταδιδακτορική έρευνα στην Ελλάδα, στο σχεδιασμό νέας γενιάς αντιπροσωπευτικών μορίων, ανταγωνιστών της Αγγειοτασινής ΙΙ. Το 2007 έλαβε μεταπτυχιακό δίπλωμα ειδίκευσης στη Διοίκηση Επιχειρήσεων (ΜΒΑ) από το Οικονομικό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Από το 2006 είναι εργαστηριακός συνεργάτης στη Σχολή Τεχνολογίας Τροφίμων του ΑΤΕΙ Αθήνας και από το 2008 ερευνητής Δ΄στο Ινστιτούτο Οργανικής και Φαρμακευτικής Χημείας του Εθνικού Ιδρύματος Ερευνών.