Ο Μιχάλης Τζεκάκης διετέλεσε επί χρόνια διευθυντής της Βιβλιοθήκης του Πανεπιστημίου Κρήτης. Μετά την αποχώρησή του από την ενεργό υπηρεσία, εργάστηκε ως εξωτερικός συνεργάτης-υπεύθυνος ανάπτυξης προγραμμάτων στη Βιβλιοθήκη της Βουλής και στη Βιβλιοθήκη της Εν Αθήναις Αρχαιολογικής Εταιρείας, και συνεργάζεται ως σύμβουλος με το Υπουργείο Παιδείας για θέματα βιβλιοθηκών.