Ο Ιωάννης Πρατικάκης είναι μέλος ΔΕΠ στη βαθμίδα του Επίκουρου Καθηγητή στο Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών του Δημοκριτείου Πανεπιστημίου Θράκης (ΔΠΘ). Απέκτησε το διδακτορικό του δίπλωμα τον Ιανουάριο του 1999 στην επεξεργασία και ανάλυση ψηφιακής τριδιάστατης εικόνας στο Πανεπιστήμιο των Βρυξελλών (Vrije Universiteit Brussel) στο Βέλγιο. Μέχρι το 2000, εργάσθηκε στον ερευνητικό οργανισμό IRISA στη Ρεν της Γαλλίας, ως μεταδιδακτορικός υπότροφος του Εθνικού Ινστιτούτου Ερευνας στην Πληροφορική και στον Αυτοματισμό (INRIA). Από το 2003 μέχρι και το 2010 που διορίσθηκε στο ΔΠΘ εργαζόταν ως συνεργαζόμενος ερευνητής στο Ινστιτούτο Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιών του ΕΚΕΦΕ "Δημόκριτος". Τα ερευνητικά του ενδιαφέροντα εστιάζουν στην επεξεργασία και ανάλυση εικόνας, βίντεο και 3Δ γραφικών, στην όραση υπολογιστή καθώς και στην αναγνώριση προτύπων. Σε αυτές τις ερευνητικές περιοχές έχει δημοσιεύσει περισσότερες από 150 εργασίες σε διεθνή επιστημονικά περιοδικά και συνέδρια. Εχει συμμετάσχει σε περισσότερα από 20 Εθνικά και Ευρωπαϊκά ερευνητικά έργα.Εχει διατελέσει μέλος του Διοικητικού Συμβουλίου της Ελληνικής Εταιρείας Τεχνητής Νοημοσύνης (ΕΕΤΝ) για την περίοδο 2010 - 2014, είναι senior μέλος της Διεθνούς Συνομοσπονδίας Ηλεκτρολόγων και Ηλεκτρονικών Μηχανικών (ΙΕΕΕ), είναι μέλος του Τεχνικού Επιμελητηρίου Ελλάδος (ΤΕΕ) και της Διεθνούς Ομοσπονδίας Eurographics. Από το 2008, είναι μέλος της ομάδας εργασίας ΕΛΟΤ/ΤΕ48/ΟΕ1 που αφορά στην εκπόνηση Ελληνικών προτύπων για την "Ορολογία Πληροφορικής".