Η Φραγκίσκα Κεφαλλωνίτου γεννήθηκε στην Αγία Τριάδα Τήνου το 1951. Σπούδασε αρχαιολογία, με ειδίκευση στις βυζαντινές αρχαιότητες. Το 1978 εντάχθηκε στην αρχαιολογική υπηρεσία. Μεταξύ 2000-2006 διετέλεσε προϊσταμένη της 8ης Εφορείας Βυζαντινών Αρχαιοτήτων στα Ιωάννινα. Το 2006 ανέλαβε τη διεύθυνση της 22ης Εφορείας Βυζαντινών Αρχαιοτήτων, στη Ναύπακτο, με τη σύστασή της. Έφυγε από τη ζωή ξαφνικά, στην ίδια πόλη, στις 4 Μαρτίου 2009, εξαιτίας προβλημάτων υγείας που αντιμετώπιζε.