Η Ειρήνη Κίτσου-Μυλωνά εργάζεται στο Συμβούλιο της Ευρώπης ως στέλεχος της Υπηρεσίας Εκτέλεσης Αποφάσεων του Ευρωπαϊκού Δικαστηρίου Δικαιωμάτων του Ανθρώπου. Από τον Απρίλιο του 2006 έως τον Σεπτέμβριο του 2009 ήταν νομική σύμβουλος του Επιτρόπου για τα Ανθρώπινα Δικαιώματα του Συμβουλίου της Ευρώπης.